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DOI10.1080/03632415.2016.1210517
StreamThermal: A Software Package for Calculating Thermal Metrics from Stream Temperature Data
Tsang, Yin-Phan1,6; Infante, Dana M.1; Stewart, Jana2; Wang, Lizhu3; Tingly, Ralph W., III1; Thornbrugh, Darren4,5; Cooper, Arthur R.1; Daniel, Wesley M.1
发表日期2016-09-01
ISSN0363-2415
卷号41期号:9页码:548-554
英文摘要

Improving quality and better availability of continuous stream temperature data allow natural resource managers, particularly in fisheries, to understand associations between different characteristics of stream thermal regimes and stream fishes. However, there is no convenient tool to efficiently characterize multiple metrics reflecting stream thermal regimes with the increasing amount of data from continuously recording data loggers. This article describes a software program packaged as a library in R to facilitate this process. With this freely available package, users will be able to quickly summarize metrics that describe five categories of stream thermal regimes: magnitude, variability, frequency, timing, and rate of change. The installation and usage instruction of this package, the definition of calculated thermal metrics, as well as the output format from the package are described, along with an application showing the utility for multiple metrics. We believe that this package can be widely utilized by interested stakeholders and can greatly assist future fisheries studies. Mejorar la calidad y disponibilidad de datos continuos de temperatura en los rios permite a manejadores de recursos naturales, particularmente en pesquerias, entender la relacion entre diferentes caracteristicas de regimenes termicos en los rios y los peces que los habitan. No obstante, no existe una herramienta conveniente para caracterizar de forma eficiente diferente metricas que reflejen regimenes termicos fluviales mediante la creciente cantidad de datos provenientes de dispositivos de registro continuo. En este articulo se describe un software programado en lenguaje R con el fin de facilitar dicho proceso. Con este software de acceso gratuito, los usuarios seran capaces de resumir rapidamente las metricas que describen cinco categorias de regimenes termicos en rios: magnitud, variabilidad, frecuencia, sincronizacion y tasa de cambio. Se describe la instalacion e instrucciones de uso, la definicion de las metricas utilizadas y el formato de salida de los archivos del programa; asi mismo se ofrece una aplicacion que muestra la utilidad de diferentes metricas. Creemos que este paquete puede ser ampliamente utilizado por usuarios interesados y puede ser de ayuda en un futuro para estudios de pesquerias. L'amelioration de la qualite et une meilleure disponibilite des donnees en continu de la temperature des cours d'eau permet aux gestionnaires de ressources naturelles, en particulier dans les pecheries, de comprendre les associations entre les differentes caracteristiques des regimes thermiques des cours d'eau et les poissons de ruisseaux. Cependant, il n'existe pas d'outil pratique pour caracteriser efficacement plusieurs parametres refletant les regimes thermiques des cours d'eau avec une quantite croissante de donnees provenant d'enregistreurs de donnees en continu. Cet article decrit un logiciel conditionne en package sous R pour faciliter ce processus. Avec ce package, disponible gratuitement, les utilisateurs seront en mesure de resumer rapidement les parametres decrivant cinq categories de regimes thermiques des cours d'eau: l'amplitude, la variabilite, la frequence, le temps, et le taux de changement. Les instructions d'installation et d'utilisation de ce package, la definition des parametres thermiques calcules, ainsi que le format de sortie du package sont decrits, et une application montre l'utilite de plusieurs parametres.


Nous croyons que ce package peut etre largement utilise par les parties interessees et peut grandement aider les futures etudes sur les peches.


语种英语
WOS记录号WOS:000383409400013
来源期刊FISHERIES
来源机构美国环保署
文献类型期刊论文
条目标识符http://gcip.llas.ac.cn/handle/2XKMVOVA/61461
作者单位1.Michigan State Univ, Dept Fisheries & Wildlife, 1405 S Harrison Rd,Suite 318, E Lansing, MI 48823 USA;
2.US Geol Survey, Wisconsin Water Sci Ctr, Middleton, WI USA;
3.Int Joint Commiss, Great Lakes Reg Off, Windsor, ON, Canada;
4.Oak Ridge Inst Sci & Educ, Oak Ridge, TN USA;
5.US EPA, Natl Hlth & Environm Effects Res Lab, Western Ecol Div, Corvallis, OR USA;
6.Univ Hawaii Manoa, Dept Nat Resources & Environm Management, 1910 East West Rd,Sherman 243, Honolulu, HI 96822 USA
推荐引用方式
GB/T 7714
Tsang, Yin-Phan,Infante, Dana M.,Stewart, Jana,et al. StreamThermal: A Software Package for Calculating Thermal Metrics from Stream Temperature Data[J]. 美国环保署,2016,41(9):548-554.
APA Tsang, Yin-Phan.,Infante, Dana M..,Stewart, Jana.,Wang, Lizhu.,Tingly, Ralph W., III.,...&Daniel, Wesley M..(2016).StreamThermal: A Software Package for Calculating Thermal Metrics from Stream Temperature Data.FISHERIES,41(9),548-554.
MLA Tsang, Yin-Phan,et al."StreamThermal: A Software Package for Calculating Thermal Metrics from Stream Temperature Data".FISHERIES 41.9(2016):548-554.
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