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青藏高原土壤细菌多样性调查(V1.0)(2015)
其他题名Bacteria distribution in Tibetan soils (version 1.0) (2015)
计慕侃
数据提供者计慕侃;
发布日期2020
维护机构国家青藏高原科学数据中心
中文关键词土壤 细菌分布 微生物
中文简介青藏高原土壤细菌多样性数据集提供了青藏高原土壤表层(0-2厘米)微生物分布特征。样品采集时间为2015年7月1日至7月15日,包含草甸,草原,荒漠3种生态系统。土壤样品用冰袋保存,运回北京青藏高原研究所生态实验室。土壤DNA通过MO BIO PowerSoil DNA试剂盒提取。土壤表层样品采集后用液氮保存,运回悉尼实验室,通过FastPrep DNA试剂盒提取。提取后的DNA样品使用515F (5'-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3') and 909r (5'-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3')扩增16S rRNA基因片段。扩增后的片段通过Illumina Miseq PE250方式测序,原始数据通过Mothur软件分析。首先去除测序质量不佳序列,之后进行排序并去除嵌合体序列。之后计算序列之间相似度,相似度在97%以上的序列聚类为一个OTU,并定义OTU代表序列。OTU代表序列通过与Silva数据库进行比对,在可靠性大于>80%的情况下鉴定到属一级水平。本数据系统的比较了青藏高原微生物的多样性,对研究微生物在青藏高原的分布具有重大意义。
空间范围青藏高原
时间范围2015
可获取性离线申请
语种中文
国家中国
学科子类生物圈;土壤学
文献类型数据集
条目标识符http://gcip.llas.ac.cn/handle/2XKMVOVA/167274
推荐引用方式
GB/T 7714
计慕侃. 青藏高原土壤细菌多样性调查(V1.0)(2015).2020-01-01.
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