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青藏高原土壤细菌多样性调查(V1.0)(2015) | |
其他题名 | Bacteria distribution in Tibetan soils (version 1.0) (2015) |
计慕侃 | |
数据提供者 | 计慕侃; |
发布日期 | 2020 |
维护机构 | 国家青藏高原科学数据中心 |
中文关键词 | 土壤 细菌分布 微生物 |
中文简介 | 青藏高原土壤细菌多样性数据集提供了青藏高原土壤表层(0-2厘米)微生物分布特征。样品采集时间为2015年7月1日至7月15日,包含草甸,草原,荒漠3种生态系统。土壤样品用冰袋保存,运回北京青藏高原研究所生态实验室。土壤DNA通过MO BIO PowerSoil DNA试剂盒提取。土壤表层样品采集后用液氮保存,运回悉尼实验室,通过FastPrep DNA试剂盒提取。提取后的DNA样品使用515F (5'-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3') and 909r (5'-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3')扩增16S rRNA基因片段。扩增后的片段通过Illumina Miseq PE250方式测序,原始数据通过Mothur软件分析。首先去除测序质量不佳序列,之后进行排序并去除嵌合体序列。之后计算序列之间相似度,相似度在97%以上的序列聚类为一个OTU,并定义OTU代表序列。OTU代表序列通过与Silva数据库进行比对,在可靠性大于>80%的情况下鉴定到属一级水平。本数据系统的比较了青藏高原微生物的多样性,对研究微生物在青藏高原的分布具有重大意义。 |
空间范围 | 青藏高原 |
时间范围 | 2015 |
可获取性 | 离线申请 |
语种 | 中文 |
国家 | 中国 |
学科子类 | 生物圈;土壤学 |
文献类型 | 数据集 |
条目标识符 | http://gcip.llas.ac.cn/handle/2XKMVOVA/167274 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 计慕侃. 青藏高原土壤细菌多样性调查(V1.0)(2015).2020-01-01. |
条目包含的文件 | 条目无相关文件。 |
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